Природа – это то, что нас окружает, она влияет на деятельность человека и его развитие во времени. Экспозиция «Флора и фауна Щекинского края» посвященная двум темам: доисторическому развитию природы и современному. Доисторическая природа Щекинского края представлена богатыми археологическими находками мезозойского, палеозойского, кайнозойского (ледникового) периодов. Окаменелости моллюсков, белемниты, аммониты, отпечатки раковин и стеблей растений, кости морских ящеров плезиозавров говорят о том, что более 150 миллионов лет назад современная территория Щекинского района находилась под водой. Кости мамонтов, каменные и железные топоры, осколки кремниевых стел, найденные на территории района, могут дать представлении о жизни первобытных людей, населявших эту землю 40 тысяч лет назад. Современная природа Щекинского края – животные и птицы, которых можно встретить не только в Щекинских лесах, но и по всей Тульской области. Большой интерес и восторг у посетителей музея вызывает коллекция чучел птиц.